基于液相芯片“黃海芯1號(hào)”55K SNP信息開展凡納濱對(duì)蝦收獲體重的ssGWAS和FarmCPU分析
水產(chǎn)學(xué)報(bào)
頁(yè)數(shù): 11 2024-12-01
摘要: 為鑒定出與凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn)和功能基因,本研究針對(duì)來(lái)自具有快速生長(zhǎng)特性的選育和引進(jìn)品系共74個(gè)家系進(jìn)行生長(zhǎng)和存活測(cè)試,利用液相芯片“黃海芯1號(hào)”(55K SNP)對(duì)其中39個(gè)家系個(gè)體進(jìn)行高通量基因分型,通過(guò)ssGBLUP方法估計(jì)了體重性狀的基因組遺傳參數(shù),并首次利用ssGWAS和FarmCPU方法解析了可能與其關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)及功能基因。遺傳參數(shù)估計(jì)結(jié)果顯示,收... (共11頁(yè))