基于Transformer和門控循環(huán)單元的肽序列理論串聯(lián)質(zhì)譜圖預(yù)測方法
計(jì)算機(jī)應(yīng)用
頁數(shù): 7 2024-04-12
摘要: 針對現(xiàn)有理論串聯(lián)質(zhì)譜圖預(yù)測僅限于預(yù)測b、y主干碎片離子以及單一模型難以捕捉肽序列復(fù)雜關(guān)系的問題,提出一種基于Transformer和門控循環(huán)單元(GRU)的肽序列理論串聯(lián)質(zhì)譜圖預(yù)測方法,名為DeepCollider。首先,通過自注意力機(jī)制和長距離依賴關(guān)系,使用Transformer和GRU結(jié)合的深度學(xué)習(xí)架構(gòu)增強(qiáng)對肽序列與碎片離子強(qiáng)度關(guān)系的建模能力;其次,與現(xiàn)有方法編碼肽序列預(yù)測... (共7頁)
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